Xhuliano Brace rápidamente se dio cuenta de que los capitalistas de riesgo no emitirían grandes cheques para dos fundadores menores de 30 años que adoptaban lo que él llama un enfoque “contrario” al uso de la IA para desarrollar nuevos medicamentos.
Entonces él mismo hace la apuesta.
Después de trabajar en proyectos de inteligencia artificial en Amazon durante cuatro años, Brace dejó el gigante tecnológico para autofinanciar su visión. Utilizando sus ahorros personales y las ganancias del comercio en línea, invirtió una suma de seis cifras en Rhizome Research, una startup con sede en Seattle que desarrolla pequeñas moléculas personalizadas similares a medicamentos.
Después de su lanzamiento el año pasado, la startup de cinco empleados recientemente salió del sigilo. Además del director ejecutivo Brace, que tiene títulos en matemáticas, informática y economía de la Universidad de Albany, el liderazgo de Rhizome incluye:
- Yiwen Wang, cofundador y científico jefe que tiene un doctorado en química de la Universidad Carnegie Mellon.
- Gregory Sinenka, tecnólogo jefe, doctorado en física, trabajó en un centro de investigación europeo y en Johnson & Johnson.
- John Proudfoot, ex director de la División de Química Medicinal de Boehringer Ingelheim con sede en Estados Unidos, actúa como asesor científico.
Un enfoque diferente para el desarrollo de fármacos
En lugar de trabajar con herramientas existentes para construir moléculas, Rhizome creó su propio modelo básico perfeccionado llamado r1. La tecnología es una “red neuronal gráfica” y se ha entrenado en más de 800 millones de pequeñas moléculas similares a fármacos.
El enfoque difiere del popular modelo RoseTTAFold del Instituto de Diseño de Proteínas de la Universidad de Washington, que en esencia se basa en los aminoácidos que forman las proteínas.
El modelo r1 se centra en los átomos y enlaces que forman una molécula, así como en su topografía. Aquí es donde entra en juego la idea del diagrama: los átomos corresponden a puntos de un diagrama, mientras que los enlaces se asemejan a las líneas que los conectan.
El objetivo del equipo es permitir el descubrimiento de fármacos basado en fragmentos y crear moléculas pequeñas optimizadas para unirse a objetivos especificados por el cliente. Garantizan que cada fármaco candidato pueda sintetizarse eficientemente en el laboratorio y sea adecuado para la protección de patente.
Rhizome lanzó la semana pasada ADAMS, una herramienta de inteligencia artificial automatizada de código abierto que utiliza instrucciones en lenguaje natural para simular la unión entre moléculas biológicas. También planea compartir MolSim, una simulación basada en la física que utiliza cálculos avanzados de energía libre que predicen con qué fuerza se unirá una pequeña molécula a su objetivo. MolSim no será de código abierto.
Visión para un centro en Seattle
Rhizome se ha asociado recientemente con laboratorios que pueden validar el rendimiento en el mundo real de los posibles medicamentos que desarrolla y está explorando las relaciones con los clientes.
Brace opera desde Foundations, la comunidad de startups con sede en Seattle fundada por el empresario e inversor Aviel Ginzburg. Los demás empleados de Rhizome están trabajando de forma remota, pero hay planes de traer gente a Washington.
“Realmente quiero hacer de Seattle una especie de centro para el descubrimiento de fármacos de moléculas pequeñas”, dijo Brace.
Señaló al Instituto Allen, el Instituto para el Diseño de Proteínas y otras organizaciones del área de Seattle como actores clave. La región también alberga una serie de nuevas empresas de desarrollo de fármacos relacionadas, incluidas Pauling.AI, Synthesize Bio y Xaira Therapeutics, con sede en San Francisco y laboratorios en Seattle.
Brace dijo que se siente fortalecido por la oportunidad de trabajar en un proyecto que podría tener un impacto significativo en la humanidad y que no se arrepiente de haber dedicado su propio dinero al esfuerzo. En general, es optimista sobre el uso de la IA para desarrollar moléculas, ya sea en la atención sanitaria o en áreas como la ciencia de materiales y la fabricación avanzada.
“Esta es el área problemática más interesante que existe”, dijo Brace.
About The Author
